Penelitian baru telah mengidentifikasi jejak dua garis keturunan manusia “hantu” yang tersembunyi di dalam genom modern. Satu garis keturunan berbagi DNA dengan setiap orang di Bumi. Kelompok lainnya adalah kelompok “super-kuno” yang menyimpang hampir dua juta tahun lalu.
Temuan ini dilaporkan pada 30 Juli di jurnal Science.
“Penelitian ini memperkuat perubahan mendasar dalam cara kita memandang evolusi manusia,” kata Priya Moorjani. Dia adalah ahli genetika evolusi manusia di UC Berkeley. “Daripada sekedar pohon bercabang sederhana…sejarah manusia semakin muncul sebagai jaringan populasi yang kompleks yang dihubungkan oleh episode divergensi dan percampuran yang berulang.”
Studi ini menantang gagasan bahwa manusia modern (Homo sapiens ) berevolusi secara terisolasi. Sebaliknya, hal ini menunjukkan bahwa kita adalah produk dari berbagai spesies yang saling kawin. Hibridisasi tampaknya menjadi hal yang lumrah. Tidak terkecuali.
Mengapa Silsilah Hantu Kuno Penting bagi Genetika Modern
Selama beberapa dekade, para ilmuwan mengetahui bahwa manusia non-Afrika membawa sekitar 1–2,4% DNA Neanderthal. Orang Asia dan Oseania juga memiliki 0,1–6% keturunan Denisovan. Namun para ahli menduga ada kelompok lain yang tidak teridentifikasi terlibat.
Kontributor yang tidak diketahui ini disebut “silsilah hantu”.
Menemukannya sulit. DNA kuno terdegradasi dengan cepat. Ia hanya bertahan hidup di lingkungan yang dingin dan kering. Hal ini membuat Afrika dan wilayah tropis lainnya sebagian besar tidak tersentuh oleh genetika arkeologi tradisional. Kita kekurangan fosil untuk mengidentifikasi siapa kelompok-kelompok ini.
“DNA kuno telah mengubah pemahaman kita… namun DNA hanya dapat memberi tahu kita tentang populasi di mana DNA telah dilestarikan,” kata Moorjani.
Studi baru ini mengubah keadaan. Para peneliti mengembangkan metode untuk memindai lebih dari 500 genom modern yang lengkap. Mereka tidak membutuhkan fosil. Mereka mengandalkan rekonstruksi silsilah genetik. Dengan memetakan setiap perbedaan dan penggabungan dalam pohon keluarga, mereka mencari rangkaian DNA yang terpisah dari garis nenek moyang manusia jauh di masa lalu.
Jika nenek moyang suatu segmen genetik terletak lebih jauh ke belakang daripada pemisahan standar, hal ini menandakan adanya peristiwa kawin silang di masa lampau.
Sinyal “Super-Kuno” dalam DNA Oseania
Salah satu penemuan paling mencolok melibatkan garis keturunan yang terpisah dari nenek moyang kita sekitar 1,8 juta tahun yang lalu. Kelompok “super-kuno” ini mendahului nenek moyang manusia, Neanderthal, dan Denisovan.
Bukti percampuran kuno ini ditemukan secara khusus pada orang-orang dari Oseania.
Rata-rata, DNA super-kuno ini membentuk 0,002% genom Oseania. Tampaknya di wilayah yang dikenal sebagai Denisovan. Hal ini menunjukkan bahwa material super-kuno masuk ke manusia modern melalui perkawinan silang Denisovan.
Siapakah silsilah ini?
Fernando Villanea, ahli genetika populasi, menyarankan Homo erectus. H. erectus adalah spesies manusia yang paling lama bertahan hidup. Garis waktunya cocok. Tengkorak yang ditemukan di Yunxian, Tiongkok memiliki ciri yang sama dengan fosil Denisovan. Namun hanya sebatas H. materi genetik erectus telah dianalisis sejauh ini. Hantu tersebut sebagian besar masih belum terbukti secara genetis. Namun, sinyalnya masih ada.
Bagaimana Manusia Modern Mewarisi Nenek Moyang Hantu dari Afrika
Silsilah hantu kedua berbeda. Hal ini tidak terbatas pada satu wilayah saja.
Itu hadir di semua manusia modern.
Hal ini menandakan peristiwa kawin silang terjadi di Afrika. Itu terjadi lebih dari 50,00 tahun yang lalu. Ini mendahului H. sapiens migrasi keluar Afrika.
Yulin Zhang, peneliti utama lainnya, menjelaskan bahwa penelitian sebelumnya memperdebatkan apakah nenek moyang kuno yang tidak diketahui spesifik untuk Afrika. Mereka tidak dapat memastikan waktunya. Metode baru mengubah hal itu.
“Kami sebenarnya dapat menemukan dan memetakan lokasi genom pada manusia modern yang berasal dari garis keturunan hantu ini,” kata Zhang. “Dan tunjukkan bahwa nenek moyang hantu ini ada pada semua manusia modern, tidak hanya pada orang Afrika.”
DNA ini terdiri dari sekitar 0,5% hingga 2% genom modern. Hal ini sebanding dengan kontribusi Neanderthal. Silsilahnya menyimpang sekitar 800,00 tahun yang lalu. Pada saat yang sama dengan perpecahan Neanderthal-Denisovan.
Kandidat grup ini termasuk Homo heidelbergensis. Spesies ini hidup di Afrika dan Eropa dari 700,00 hingga 200 tahun yang lalu.
Chris Stringer dari Museum Sejarah Alam London setuju dengan spekulasi tersebut. H. heidelbergensis hadir di Afrika sekitar 300,0 tahun yang lalu. Garis waktunya cocok.
Imunitas, Metabolisme, dan Biaya Pencampuran
Segmen DNA hantu tidak ditempatkan secara acak. Mereka mengelompok di wilayah tertentu.
Sebagian besar ditemukan pada gen yang terkait dengan sistem kekebalan. Lainnya berhubungan dengan fungsi metabolisme.
Kenapa disini?
Moorjani berpendapat hal itu masuk akal. Beradaptasi dengan kuman dan sumber makanan baru merupakan pendorong utama evolusi manusia. Perkawinan silang memberikan cara cepat untuk memperoleh varian yang bermanfaat. Gen Neanderthal dan Denisovan menawarkan keuntungan di lingkungan baru. Nenek moyang hantu ini kemungkinan besar memberikan dorongan serupa.
Hal ini mendukung pandangan bahwa evolusi manusia adalah suatu jaringan yang berantakan dan saling berhubungan.
“Kami melihat hibridisasi menjadi ciri umum,” kata Villanea. “Temuan ini membantu kita mengubah pemikiran ilmiah kita dari mentalitas keistimewaan manusia.”
Metode ini sudah terbukti bermanfaat lebih dari sekedar mengidentifikasi hantu masa lalu. Ia dapat merekonstruksi genom spesies primitif seperti H. ereksi. Ia dapat mempelajari spesies lain yang tidak memiliki DNA fosil.
Tujuannya adalah untuk melihat lebih dalam. Para peneliti ingin menemukan lebih banyak silsilah hantu. Terutama dari wilayah yang kurang terwakili seperti Afrika dan Asia Selatan.
Kita baru saja mulai membaca sejarah tersembunyi dalam darah kita. Dan ceritanya lebih rumit dari yang pernah kita bayangkan.
